انتشار فصلنامه بیماری‌های گیاهی به عنوان تنها مجله تخصصی علمی-پژوهشی در زمینه بیماری‌شناسی گیاهی در کشور. در حال حاضر این مجله دارای سایت اختصاصی است و کلیه امور پذیرش و داوری مقاله به صورت الکترونیکی و از طریق سایت انجام می‌شود. برگزاری سخنرانی‌های علمی و کارگاه‌های آموزشی جهت بازآموزی نیروهای متخصص، همچنین برگزاری اجتماعات و کنگره‌های علمی به منظور ارتباط و تبادل نظر اعضاء با یکدیگر. در این رابطه انجمن یکی از برگزارکنندگان کنگره گیاهپزشکی ایران است. این کنگره که از سال 1347 تاکنون برگزار می‌شود، یکی از بزرگترین اجتماعات علمی کشور محسوب می‌گردد. همچنین انجمن در طرح ممیزی علوم مشارکت داشته و مسئول ممیزی علم بیماری‌شناسی گیاهی در کشور است. انجام و حمایت از پروژه‌های تحقیقاتی در زمینه بیماری‌های گیاهی و علوم وابسته از فعالیتهای دیگر انجمن است.