انجمن ژئوفیزیک ایران در تاریخ 1354/11/11 با نام انجمن ملی ژئوفیزیک ایران با همت آقایان دکتر حسین کشی افشار، دکتر حسین زمردیان، دکتر خسرو معظمی گودرزی ، مهندس علی اکبرمعین فر، دکتر منوچهر سادات اخوی ، مهندس امیر حسین موسوی و دکترفریبرز جهان بخش تشکیل و با ثبت در روزنامه رسمی کشور به شماره 9270 مورخ 1355/08/02فعالیت خود را آغاز نمود.
پس از پیروزی انقلاب اسلامی این انجمن در تاریخ 1373/07/24 از دفتر همکاری های علمی بین المللی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری ثبت مجدد را با ارسال صورتجلسه مجمع عمومی مورخ 13731/06/31 و اساسنامه تطبیق داده شده با الگوی پیشنهادی درخواست کرد. پیرو جلسه شماره 18 کمیسیون انجمن های علمی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری مجوز صدور فعالیت مجدد با نام انجمن ژئوفیزیک ایران صادر شد.
انجمن با انتخاب اولین هیأت مدیره دوره پس از دریافت مجوز در سال 1380، فعالیت خود را مجدداً آغاز نمود و در حال حاضراعضای سومین دوره هیأت مدیره مشغول به فعالیت هستند.